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これまでの研究成果

ゼブラフィッシュ視細胞サブタイプのネットワークの同定

背景

脊椎動物の視細胞は桿体と錐体の2種類に大別され、このうち、錐体は明るい場所での視覚を担う。さらに、異なる光波長に応答する錐体サブタイプを組み合わせることで、錐体は色覚を担う。脊椎動物が持つ錐体オプシン遺伝子の分子系統比較により、脊椎動物の祖先は紫・青・緑・赤の4種類の錐体オプシンを備え、4色型の色覚を原型とすると推定された。その一方で、哺乳類は青と緑の錐体オプシンを進化の過程で失っている。このため、マウスやヒト等の哺乳類モデルを用いた従来の研究では、青や緑色感受性の錐体サブタイプの生理的な意義に迫ることはできず、またこれら錐体サブタイプに備わる遺伝子発現メカニズムも全くわかっていなかった。

脊椎動物の錐体オプシン遺伝子の系統比較
図1 脊椎動物の錐体オプシン遺伝子

研究成果

私たちは、4種類の錐体サブタイプを備えるゼブラフィッシュにおいて、錐体の発生や分化に寄与する候補因子の機能解析を、遺伝子改変技術を用いて行った。その結果、青錐体と緑錐体それぞれのアイデンティティを規定する転写因子カスケードが明らかとなった(図2)(論文1論文2論文3)。さらに、得られた視覚変異体の摂餌行動を解析し、中波長領域感受性の錐体サブタイプの生物学的意義を明らかにした(ビデオ)(論文)

脊椎動物の系統はそれぞれの進化の過程において、錐体細胞サブタイプのレパートリを変化させて光環境に適応してきました。たとえば、哺乳類への進化の過程においては、中波長領域感受性の錐体サブタイプを進化の過程で消失しています(図1)。このように、進化の過程における細胞レパートリの増減を可能にする分子メカニズムの一例として、転写調節ネットワークの変化を見出しています。ゼブラフィッシュにおいて中波長領域感受性の錐体サブタイプの分化に必須の転写因子SIX7とFOXQ2は、哺乳類ゲノムにおいてその遺伝子が失われています。その一方、紫外と赤に感受性の錐体サブタイプを規定する転写因子(TBX2とTHRB)はゼブラフィッシュと哺乳類で共通です(日本語総説)。これらの結果から、転写因子が織りなす転写調節ネットワークを種間比較することにより、生物種を越えて細胞タイプの相同性が見出されると考えています。

ゼブラフィッシュ錐体視細胞サブタイプの転写制御ネットワーク
図2 ゼブラフィッシュ錐体視細胞サブタイプにおける転写ネットワーク

ビデオ ゼブラフィッシュ幼生の餌取り行動を変異体と野生型で比較した

変異体(TKO)と野生型コントロール(WT)の行動を比較した。白い点はそれぞれゾウリムシを示す。ゾウリムシを捕食した数を左上に示している。詳しくは論文1を参照してください。

裏話

学部生の頃からポスドク初期まで行った思い出深いテーマです。逆遺伝学的に遺伝子の探索を行う難しさを痛感しました。また、非哺乳類で見出した分子的な知見を哺乳類にて再検証するテーマはある程度ハイインパクトな研究として成立するものの、その逆の哺乳類の知見を非哺乳類へと適応するテーマは、論文のインパクトが非常に落ちてしまうというアンバランスさが身に染みました。

プロジェクトが終わって振り返ってみると、哺乳類で失われた遺伝子が、哺乳類では備わっていないシステム(青と緑感受性の錐体サブタイプの分化制御)を担うことが明らかになり、進化の過程で自然選択が生じたと強く示唆されました。比較分子生物学においては、それぞれの生物に備わる独自のシステムの解析は重要です。しかしながらさらに加えて、哺乳類と非哺乳類システムを比較して、より一般的な知識へと昇華させる必要があると実感しました。